1、颜色不同：非转基因玉米通常是金黄色的，多数彩色玉米就是转基因玉米。
2、大小不同：非转基因玉米外形比较正常，个头适中。转基因玉米成熟的快，产量也高，外形偏大。
3、颗粒大小不同：非转基因玉米的颗粒大小不相同，而转基因玉米的颗粒大小均匀。
