黄埔海关是广东省内七个直属海关之一，黄埔海关开办了除国际邮包、国际航班监管业务外的所有海关业务。黄埔海关下设黄埔新港、黄埔老港、新沙海关、东莞海关、太平海关、新塘海关、驻广州经济技术开发区办事处(广州保税区海关)、驻凤岗办事处、驻长安办事处、驻常平办事处、驻沙田办事处。

黄埔关区既是华南地区重要的海上对外贸易口岸，也是我国加工贸易开展最早、密度最大的地区之一。关区范围包括广州市天河区(一部分)、黄埔区、广州经济技术开发区、萝岗区(一部分)、广州高新技术产业开发区、广州保税区、广州出口加工区以及增城市、东莞市，面积约4440平方公里。目前已开办了除国际邮包、国际航班监管业务外的所有海关业务，包括进出境货物、运输工具及转关运输车辆监管、进出境旅客行李物品监管、加工贸易及保税监管，以及相应的征税、统计、稽查、缉私等。