肚脐眼里面的器官是肠管，有大肠、小肠，偏右下方还有回盲部阑尾，女性还有卵巢、输卵管。肚脐眼在医学上称之为神阙穴，从本质上来说是胎儿出生后脐带脱落留下的疤痕。肚脐眼位于髂前上棘水平的腹部正中线上，直径约为1.0至2.0厘米。

它通常可以是一个小凹陷或是一个小突出，肚脐眼下面的腹部肌肉也会形成一个凹陷，肚脐眼是柔弱的部分，日常应注意保护，不可受冷或手抠等。