结城友奈是勇者第二季的结局是友奈为了最终战自己完全散华，最后灵魂进入了那个灰色的空间，孤独，寂寞，害怕，所以她已经是死过一次经历了非常可怕的孤寂才又回到同伴身边的，所以她更加的珍惜同伴，也明白了死亡的可怕，虽然强撑着，但是还是不想死的。

《结城友奈是勇者第二季》的故事发生在神世纪300年，主要讲述结城友奈是初中2年级学生，她天天在学校里过着与很多朋友一同听课、进行社团活动、玩耍的平稳生活。不管怎么看这都是非常普通的女孩的生活日程，但是只有一点与其他孩子决定性不同的地方，那就是她所属的名为“勇者部”的社团活动。以部长犬吠埼风为中心的该社团的活动内容与被谜团包围的叫做Vertex的不可思议的存在有关系，本作正是以描写友奈等人的“勇者部”的活动为主。