支付宝乘车码的扣费方式包括花呗、银行卡、余额宝以及支付宝账户余额。我们可以在支付宝中设置扣费顺序，具体操作方法如下：

1、在联网状态下打开我们的手机支付宝，然后在支付宝的页面下方找到我的页面然后切换到我的页面。2、打开之后，在页面的右上角有一个设置选项，直接选择打开。3、打开后我们找到页面内的支付设置并打开。4、打开后选择扣款顺序然后就可以选择我们想要的扣款方式以及顺序了。