在很多革兰式阴性菌及少数革兰式阳性菌的细胞表面存在着一些比鞭毛更细、更短而直硬的丝状物，称为菌毛或称伞毛、纤毛。菌毛在普通显微镜下看不到，必须用电子显微镜观察。菌毛由结构蛋白亚单位菌毛蛋白组成，具有抗原性。菌毛类型很多，根据菌毛功能可将其分为两大类:

1．普通菌毛:可增加细菌吸附于其他细胞或物体的能力。例如肠道菌的I型菌毛，它能牢固的吸附在动植物、真菌以及多种其他细胞上，包括人的呼吸道、消化道和泌尿道的上皮细胞上

2．性菌毛 :是在性质粒控制下形成的，它比普通菌毛粗而长，中空呈管状，数量少。性菌毛是细菌传递游离基因的器官，作为细菌接合时遗传物质的通道。现在很多学者趋向于用纤毛表示普通菌毛，而菌毛多指性菌毛。