杭州的公租房应该到其户口户籍所在区的建设（库管）局进行申请。申请流程如下：

1、申请家庭到户籍所在区建设（房管）局领取《2010年杭州市区公共租赁住房申请表Ⅰ》及其它相关表格。

2、属于《受理公告》申请对象范围的申请人填写好《申请表》到夫妻双方单位和家庭成员单位盖章后，在日常工作时间携带《申请表》、申请材料到户籍所在区建设（房管）局申请公示登记。

3、公示期间有异议的申请家庭根据社区通知提供相应证明材料。

4、经审核基本符合准入条件的申请人在《选房公告》规定的时间携带身份证、户口本及婚姻证明原件到户籍所在区建设（房管）局进行受理登记。经校验原件后，签字领取《受理单》。