协议解除劳动合同程序具体如下：

1、解除劳动合同的提出：公司及员工均有权提出解除劳动合同;

2、达成一致：双方在自愿、平等协商的基础上达成一致意见;

3、工作交接：用人部门安排员工依照相关规定办理工作交接;

4、结算薪资和经济补偿：在员工办理完毕工作交接后，财务科应当结算并支付该员工的薪资;如果是公司提出解除合同，还应当结算并支付该员工的经济补偿;

5、完成上述流程后，劳动合同按双方约定解除;

6、在解除劳动合同时，公司人事部门出具解除劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续;

7、对解除的劳动合同的文本原稿及原电子档案进行备案，至少保存二年备查。

【法律依据】

《劳动合同法》第三十六条协商解除劳动合同，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。