南京市2017年全日制不同专业学位研究生学费标准如下：按物价部门批准，其中会计硕士共6万元，工程硕士共4万元，艺术硕士共6万元，艺术硕士共4、5万元，其他类别领域1万元每年。

除此之外还有南京大学奖助体系。南京大学对纳入全国研究生招生计划的全日制新入学硕士研究生设立“助学金”，每月500元每人。同时设立三个等级的“学业奖学金”，奖额为每年6000至12000元每人。在全日制硕士研究生中，教育部设有“国家奖学金”，额度20000元每人。非全日制研究生不享受助学金、学业奖学金和国家奖学金。此外，学校设有各项冠名奖学金和“助教研管”岗位。全日制研究生还可申请国家信用助学贷款。