经教育部批准，目前拥有研究生院的南京高校只有如下6所：南京大学（985 211 综合类）、东南大学（985 211 综合类）、南京理工大学（国防985 211 工科类）、南京航空航天大学（国防985 211 工科类）、河海大学（211 工科类）、南京农业大学（211 农业类）。而南京财经大学（财经类）虽然没有研究生院也不是211工程院校，但是在经济学方面较突出。一般情况下，以上七所学校在经济学上若分三档，则第一档高校：南京大学；第二档高校：东南大学、南京财经大学、南京理工大学、南京航天航空大学；第三档高校：南京农业大学、河海大学。由于各大学的强势专业不同，其根据不同专业的大学排名也有所不同。