根据《土地管理法》等法律法规的规定，农村以及居民建房用地办许可证的程序是这样的：

1、符合申请宅基地条件的农村村民，应向村民委员会提出书面申请。

2、由村民委员会提请村民会议讨论决定宅基地的使用。经村民代表会议或村民会议讨论通过，并在本村或村民小组张榜公布，由村民委员会签署意见送乡（镇）国土资源所审查，并将会议记录及讨论决定报乡（镇）国土资源所备案。

3、经乡（镇）人民政府（街道办事处）审核，报县（市）人民政府审批。