领事馆与大使馆区别主要是其机构性质不同，大使馆是一国在建交国首都派驻的常设外交代表机关。领事馆是一国政府派驻对方国家某个城市并在一定区域执行领事职务的政府代表机关。

大使馆代表整个国家的利益，全面负责两国关系，馆长是大使，由国家元首任命并作为国家元首的代表履行职责。而领事馆是为了保证当地本国居民的权益而设置的机构，其领导人为总领事长。