杀手杀肯尼迪原因如下：

1、肯尼迪因为猪猡湾事件得罪了美国军方以及中情局的特工。

2、肯尼迪强行让调查局服从司法部的领导，并打算改组联邦调查局罢免胡佛。因此得罪了联邦调查局。

3、肯尼迪让黑人拥有选举权得罪了美国政府上层的反黑人势力。

4、肯尼迪打算把德克萨斯州的财团势力踢出权力核心。

5、肯尼迪时期强力打黑，得罪了美国黑手党。