百合的花种有朝鲜百合、山百合、珠芽百合、布朗百合、加拿大百合、白百合、渥丹台湾百合、日内瓦百合、星象家百合、湖北百合、洪堡百合、荷兰百合、卷丹、麝香百合、欧洲百合、紫斑百合、豹纹百合、山丹百合、峨眉百合、艳红鹿子百合、玉米百合等百余种。

百合花色因品种不同而色彩多样，多为黄色、白色、粉红、橙红，有的具紫色或黑色斑点，也有一朵花具多种颜色的，极美丽，花瓣有平展的，有向外翻卷的，故有卷丹美名，有的花味浓香，故有麝香百合之称，花落结长椭圆形蒴果。