函授本科毕业档案保管有以下三种：

1、有单位接收者，应聘成功者，且单位有档案管理权利，档案可以留到单位，交给人事管理处的工作人员即可。

2、有单位接收者，但单位无管理档案的权利时，或者无单位接收者，可以与当地人才交流中心进行交流，支付一定费用，帮助保管一段时间。

3、若人才交流市场无法保管，可咨询当地户籍以及档案科查看档案的暂存地，直接将本人函授的学籍与其他的档案合并存放即可。