新鲜木耳可生吃，清洗干净拌凉菜，多以炒食为主，用肉炒或其他蔬菜搭配炒吃更佳，也可做汤。

新鲜木耳本身并不含毒性，但黑木耳营养丰富，泡在水中容易引起细菌繁殖，遇到高适宜的环境，细菌繁殖速度就会变快，导致生物毒素的形成。未经处理的生鲜黑木耳不能直接食用，但大多超市中所卖的“新鲜木耳”，实为干木耳用水浸泡发制，并非刚摘下来的生鲜黑木耳，所以可放心食用。