东晋最后一个皇帝是晋恭帝司马德文，386年到421年。他不是被俘获的，而是在退位后被杀的。420年六月，司马德文禅位与刘裕，东晋自此灭亡；司马德文被封为零陵王，421年九月丁丑11月10日，刘裕便派人以棉被闷死司马德文，司马德文享年三十六岁。司马德文死后葬于冲平陵。420年刘裕建国宋，史称南朝宋，是为宋武帝，东晋至此灭亡。439年北魏统一华北后，至此进入南北朝时期。