各有所长，专业侧重不一样。

南京大学侧重文理等基础学科：

1、南大是一所学术氛围非常浓厚的大学，是真正做研究的地方；

2、南大的历史比较悠久，人文底蕴很高；

3、南大学科门类更齐全，擅长基础学科，如理论物理，天文学，考古历史等。

中国人民大学侧重人文社会科学：

1、 人大的社会科学，比如经济、金融、法律、社会学等优势较大；

2、人大位于北京，其资讯和资源的来源都比较有广度；

3、人大很多老师社会资源比较丰富，在人大学习社会科学类的东西在就业、学术的案例调研方面较为方便。

中国人民大学和南京大学都是中央直管教育部直属的全国重点大学，属于副部级建制的985大学，两者都很厉害。