复音口琴正确的清洗方法是：把琴放在洁净的清水中轻轻晃动，将口水析出。清洗完毕后将水控出，擦干，而后把琴口向下放置晾干。如果有污物还需要将琴拆开用牙刷轻轻刷干净。切不可用热水清洗，那会令琴格变形无法修复。

平时吹奏完毕后只需将口琴口向下在另一只手上轻轻拍出口水后用干净的布擦干，然后将琴口向上放置，晾干琴里的潮气即可。

口琴一定要完全晾干后再放进琴盒，否则极易生锈。另外不建议经常清洗口琴，一般几个月一次就可以了，演奏之前需要漱口或者刷牙。