农村房屋办理产权登记操作流程为：

1、申请，申请人进行申请房屋产权登记，既可以由权利人自己申请登记，也可以委托代理人申请房屋产权登记。

2、受理，房屋登记机关接受权利人的请求，并对权利人所提交的相关资料进行形式审查。

3、调查，登记机关对申请人的申请进行实质审查，查明房屋的客观现状的行为。审查内容包括房屋所使用土地的宗地界线、宗地面积、房屋的座落位置、房屋结构和房屋建筑面积。

4、公告，房屋登记机关在对申请人所提供的资料进行形式审查和实质审查后，以一定的方式向公众公布欲予核准房屋产权的有关事项。

5、听证，房屋登记机关因利害关系人在公告期内对房屋登记机关公布的欲予核准房屋产权的有关事项提出异议，应组织听证。

6、决定，如果申请人提交的文件资料齐全、有效，土地房屋权属来源合法、明确，登记机构应当决定予以核准登记，给权利人颁发房屋产权证书。

7、归档，农村房屋登记机关应将房屋产权登记有关资料整理归档，妥善保管，方便查阅。