物种间的基因交流是指基因重新的组合，同一物种、不同物种都可以进行物种间的基因交流，但不同物种之间的后代一般是不可育，因为后代和双亲的物种已经发生生殖隔离。

判断物种间的基因交流主要依据为一个物种的基因在另一个物种体内能否正常表达，即能否转录翻译出相应的蛋白质。