穿心莲的含有大量的二萜类，如穿心莲内酯、14-去氧穿心莲内酯、新穿心莲内酯、穿心莲新甙甙元、3α-羟基穿心莲潘林内酯甙、14-去氧-12-甲氧基穿心莲内酯以及穿心莲潘林内酯等;此外，尚含香荆芥酚，丁香油酚，肉豆蔻酸，三十一烷及三十三烷。
