1、招生对象不同

国家专项计划的招生院校是全国重点高校，招生对象面向全国。地方专项计划的招生院校是地方重点院校，招生对象面向本省。

2、报考条件不同

国家专项计划是指定县市的城市和农村的考生，只要符合报考条件和要求就可以。地方专项计划是地方高校定向招收实施区域的农村学生的专项计划。

高校专项计划的招生院校是教育部直属高校和其他自主招生试点高校，招生对象是农村地区成绩优秀的学生，考生必须经招生院校考核合格才可以报考，我们可以理解成是另一种类型的自主招生。三大专项计划录取批次不同。一般来说，国家专项计划录取安排在本科提前批，高校专项计划录取安排在自主招生批，地方专项计划录取安排在前两个专项计划之后录取（有的省份安排在本科一批之后录取）。