南京二手房满两年是要交个税的，只有该二手房为家庭唯一住宅且购买时间超过5年（含5年），才不需要征收个人所得税，任何一个条件不满足都必须缴纳个人所得税。地税局会审核卖方夫妻双方名下是否有其他房产作为家庭唯一住宅的依据，其中包括虽然产权证没有下放但是房管部门已经备案登记的住房（不包含非住宅类房产）。

如果是家庭唯一住宅但是购买时间不足5年则需要以纳税保证金形式先缴纳，若在一年以内能够重新购买房产并取得产权则可以全部或部分退还纳税保证金，具体退还额度按照两套房产交易价格较低的2%退还。一般是税率交易总额1%或两次交易差的20%，如果所售房产是非住宅类房产则不管什么情况都要缴纳个人所得税。个人所得税也必须征收差额的20%。