过年的时间公安局出入境管理机构不能办理港澳通行证。

依据《全国年节及纪念日放假办法》第二条规定，春节放假3天，包括农历除夕、正月初一、初二。同时根据《国务院关于部分节假日安排的通知》，春节期间放假时间一般是农历除夕到正月初六，放假调休共7天，公安局出入境管理机构不能办理港澳通行证。