1、词性不同

熟shou：熟shou一般用于口语。

熟shu：熟shu一般用于正式书面用语。

2、侧重不同

熟shou：熟shou侧重于程度深；做某种工作时间长了，精通而有经验；习惯，常见，知道清楚；经过加工炼制的。

熟shu：熟shu侧重于食物烧煮到可吃的程度；植物的果实或种子长成。

3、指代不同

熟shou：熟shou多指代人和事物。

熟shu：熟shu多指代食物和植物。