1、性质不同：行政撤职处分是一种行政惩戒措施，属于行政处分的范畴；免职是法定的人事处理种类，不具有惩戒性。

2、条件不同：对于违纪情节严重给国家和人民利益造成重大损失或严重后果的公务员，可以给予撤职处分。

3、后果不同：撤职的后果要比免职严重。

撤职表明被撤职人员有重大过错，如违纪工作严重失误，甚至是有违法行为等。免职则一般不具有惩罚性，其适用于包括因调任其他工作、轮岗交流、任职期满、退休等因素而引起的免除其所任职务的行为。